1939年李志元出生於雲林北港。自幼調皮不愛唸書他自嘲他所讀的書差不多都是後來在監獄中讀的。但他的體育非常好小學高年級時就加入棒球隊就讀嘉義高商時還代表雲林縣去參加省運。

1958年嘉商畢業後因爲同學蘇聰毅而認識了他的叔叔蘇東啟。當時蘇東啟正準備參選縣長提供李志元工作機會。而這次替蘇東啟幫忙選舉也讓他認識到中國國民黨操弄政治的民主假象。

1960年李志元到虎尾服役但放假時仍常常回北港回北港時總會去找蘇東啟聊天。蘇東啟和他談起將來欲武裝革命的企圖。李志元把蘇東啟的一些建議牢記於心並真的付諸實行於自己的人脈在軍中物色志同道合的夥伴。

1961年9月19日凌晨蘇東啟欲發動武裝革命的事蹟曝露在住宅遭逮捕。與蘇東啟往來密切的李志元也於21日被抓。他先被送到空軍總部調查處問訊再被送到保安處前後遭到疲勞訊問、刑求要他招供。1963年蘇東啟最後被判處無期徒刑李志元也判處7年有期徒刑。

李志元先是被關到安坑軍人監獄1964年被移監至台東泰源監獄。他在泰源監獄時大量的閱讀也寫文章投稿報刊。

1968年李志元獲得開釋出獄後因為政治案底的因素謀職困難輾轉於不同的工作間。而由於他以前棒球隊的經歷他利用閒暇時教導棒球隊、擔任比賽裁判。1984年他受朋友鼓勵參加裁判訓練取得國家級裁判資格全心投入棒球運動。

政治牢獄的經歷不僅影響他一生也影響他的孩子成長、求學、出社會工作都遭到非議為難。直到政黨輪替白色恐怖終於獲得平反李志元參與白色恐怖文史、人權座談、接受口述採訪而對於當初投身改革的意念與決心他認為自己是走在正確的到路上一生從未後悔過。