Ele alega ter matado a sua família e no mínimo 1000 outras pessoas. Sua mãe era uma prostituta e, devido à isso, ele não sabe nada sobre seu pai. Quando ele tinha 15 anos, Genjuro matou um dos clientes da sua mãe devido aos gritos dela por proteção de raiva do homem que estava bêbado. Quando ele estava saindo dali, sua mãe o atacou, deixando uma grande cicatriz nas suas costas, e ele a matou.[1] Virando um órfão, Nicotine Caffeine o encontrou e o treinou, junto de Haohmaru, no seu dojô.[2]
Ambos os estudantes eram bons amigos, ainda que a sede de poder de Genjuro preocupasse Nicotine. Para testar seus pupilos, ele decidiu realizar uma luta entre eles para determinar qual o mais forte, sendo um pergaminho que entrega força como prêmio. Genjuro derrota Haohmaru mas é banido do dojô por causa de sua inteções assassinas. Então ele promete matar ambos Haohmaru e Nicotine, por causa de seus ideais que contradiziam o dele na luta de espadas.[3] Ele odeia mais a Haohmaru porque ele tem aparência parecida com o homem bêbado que atacou sua mãe, e que, também, ambos sentiamse atraídos por Shiki, sendo a razão disso para Genjuro assemelharla a sua falecida mãe).[4]

Sua profissão durante suas viagens é hitokiri (ou assassino de aluguel), geralmente aceitando os trabalhos mais "sujos" como acabar com brigadas de piratas e esconderijos de criminosos.[2][5] Alguns de seus alvos foram Sankuro e Mizuki.[6]
Em Samurai Shodown: Warriors Rage, Genjuro ganha vantagem no seu último duelo contra Haohmaru. Antes que ele pudesse dar o golpe final, um garoto o apunhala em vingança de seu pai (cujo nome não foi dito). É altamente implícito que Genjuro morre desta sua ferida e, como prometido, um Haohmaru mais maduro brinda um gole de sake pela honra de seu amigo.